วันก่อนในการอบรม เราได้พูดถึงเรื่อง FASTA format กัน คือรูปแบบของ sequence ของ DNA ที่ใช้เวลาแปะไปในโปรแกรม BLAST เพื่อทำ alignment หา gene ที่เหมือนกัน เพิ่งได้รู้จริงๆว่า คำนี้อ่านว่า ฟาสต์ เอ ไม่ใช่ ฟาสต์-ต้า ก็เลยได้เข้าไปอ่านถึงคำนี้ใน Wikipedia (http://en.wikipedia.org/wiki/FASTA ) เห็นว่าเป็นความรู้รอบตัวที่ดี สำหรับคนทำงาน molecular (ที่ไม่ได้เรียนพื้นฐานมาโดยตรง เหมือนตัวเองนี่แหละค่ะ) ก็เลยแปลแบบย่อๆฝากกันค่ะ

จริงๆแล้ว FASTA นี้เป็นโปรแกรมที่เอาไว้ จัดเรียง sequence ของ DNA หรือโปรตีนที่ทำขึ้นโดย David J. Lipman and William R. Pearson ในปี 1985 โดยสมัยนั้นเรียก FASTP เพราะเอาไว้เรียงโปรตีนเพื่อหาว่าตรงกับโปรตีนตัวไหน ส่วน FASTA นั้นเกิดต่อมาในปี 1988 เพื่อให้จัดเรียงหา DNA sequence ได้ด้วย

คำนี้อ่านว่า ฟาสต์-เอ ซึ่งมาจาก FAST-All เพราะรวมทั้งในการจัดเรียง FAST-P (โปรตีน) และ FAST-N (nucleotide)

กำลังมองหาเรื่องเกี่ยวกับ DNA databases เพื่อเอามาฝากเป็นจุดตั้งต้น ค้นหา DNA sequence สำหรับพวกเราที่กำลังเริ่มอยู่ค่ะ