การทำความสะอาด PCR product โดยใช้การปั่น ของที่นี่ใช้ ผลิตภัณฑ์ของ Millipore ชื่อ Montage PCR Centrifugal Filter Device ซึ่งใช้หลักการของ membrane ที่มี pore size ขนาดเล็ก กรองเอา primer และสารต่างๆ เช่น dNTP ออกมา ในขณะที่ DNA มีโมเลกุลใหญ่ ก็จะถูกกรองติดไว้กับ membrane
วิธีนี้ เป็น device ที่ใช้งานแบบรายต่อราย (individual) ใช้แล้วทิ้ง (disposable) อุปกรณ์ทุกอย่างมีอยู่ใน kit
ขั้นตอนการทำ
1. เติม DW หรือ TE buffer 450 ul ลงใน device
2. เติม PCR product 50 ul ดูดขึ้นลง ผสมให้เข้ากัน แล้วปิดจุก (ลักษณะเหมือน Cap ของ microcentrifuge tube)
3. ปั่นที่ 5000 rpm 10 min
4. นำ device มาใส่ใน microcentrifuge tube (อันใหม่) ที่ตัดฝา cap ออก โดยวางให้ up side down
5. เติม DW หรือ TE buffer 50 ul ลงไปใน device
6. ปั่นที่ 4500 rpm 2 min
7. ดึง device ทิ้งไป แล้วดูดสารละลายใส่หลอด microcentrifuge tube อันใหม่ label ชื่อให้เรียบร้อย เก็บที่ -20C หรือต่ำกว่านั้นจนกว่าจะใช้
วิธีนี้เหมาะสำหรับการทำความสะอาด PCR product ก่อนที่จะนำไปหาลำดับเบส (sequence) เนื่องจากไม่ต้องทำการล้าง DNA ใหม่ด้วยการตกตะกอน DNA ด้วย ammonium acetate ทำให้ไม่ปนเปื้อนสารเคมีอื่นๆ และทำได้สะดวกรวดเร็ว ไม่ต้องการเครื่องมือราคาแพง
