การแปลงไฟล์ DICOM เป็น Nifti Format (3)

FST
ติดตาม ผู้ติดตาม 
ติดต่อ

ตอนนี้เป็นตอนเก็บตกกับตัวโปรแกรม dcm2nii.exe สำหรับผู้ชอบ CLI หรือ command ในชุดเครื่องมือ MRIcron ที่ได้กล่าวไปแล้ว 2 ตอนนะครับ

เจ้าตัว dcm2nii.exe นี่ครับ เมื่อเราเรียกใช้ครั้งแรก จะสร้างตัว dcm2nii.ini ซึ่งเป็นตัวเก็บค่า setting ต่างๆ ขึ้นมานะครับ ซึ่ง ตัวเลือกต่างๆ อาจจะดูงง ในตอนแรกครับ แต่มีคำอธิบายครับ เราไปดูคำอธิบายได้จากเว็ปไซต์นี้ครับ http://www.cabiatl.com/mricro/mricron/dcm2nii.html

ซึ่งผมก็ได้ทำการเก็บภาพมาให้ง่ายต่อการใช้งานไว้ครับSnap 2017-04-12 at 15.08.50

จะพบว่าเราสามารถตั้งค่าให้เจ้าตัว dcm2nii นี่เใช้ option ต่างๆ ที่น่าสนใจเช่น

  • AnonymizeSourceDICOM ถ้าเป็น 1 จะไม่แสดงชื่อผู้ป่วย
  • AppendDate =1 จะเป็นการบอกให้เจ้า dcm2nii ต่อท้ายชื่อด้วย study date
  • Gzip ถ้าเป็น 1 จะทำให้ไฟล์ที่ได้ถูกบีบอัดแล้วนามสกุลเป็น .gz
  • SPM2 เป็น 0 หมายถึงแปลงไฟล์เป็นแบบ Nifti ถ้าเป็น 1 จะแปลงเป็นรูปแบบ Analyse

เมื่อเราอ่านพอเข้าใจแล้ว ก็สามารถลองเล่นดูได้เลยครับ แล้วเปรียบเทียบผลการแปลงไฟล์ที่ได้ ว่าตรงกับความต้องการของเราหรือไม่

หลายท่านอาจจะรู้สึกว่า dcm2nii นี่ใช้ยาก ก็ไม่เป็นไรครับ อาจจะกลับไปใช้ตัว dcm2niigui.exe ที่เป็นหน้าต่าง GUI น่าจะใช้งานสะดวกสำหรับการใช้งานทั่วไปแล้วครับ...

บันทึกนี้เขียนที่ GotoKnow โดย  ใน PACS



ความเห็น (0)