การแบ่งแยกทางความเชื่อก่อเกิดการแบ่งอินเดียเป็นสองประเทศ
การเกิดสงครามกลางเมืองในอินเดีย ในรัฐปัญจาบ ชาวมุสลิมได้ฆ่าชาวฮินดูและสิกข์ก็ตอบโต้ชาวมุสลิมในทำนองเดียวกันจมเลือดนองแผ่นดินเกือบล้านคนที่ต้องจบชีวิตลงไป ในเขตแบ่งดินแดนเป็นสองฝ่ายก่อเกิดการอพยพครั้งยิ่งใหญ่ของคลื่นมหาชนสะเทือนแผ่นดินอินเดีย ชาวอินเดียและสิกข์หนีเข้ามายังฝั่งอินเดียและชามุสลิมหนีเข้าไปทางฝั่งปากีสถานอย่างสับสนอลหม่าน
คานธีพยายามระงับการฆ่าทั้งสองฝ่าย โดยการอดอาหารประท้วง มีผลให้ทางทุกศาสนาพยายามก่อให้เกิดความสงบเพื่อปกป้องชีวิต ทรัพย์สินและความเชื่อ การที่คานธีแสดงความเห็นใจต่อชาวมุสลิม อ่านข้อความจากพระคัมภีร์อัลกุรอานในท่ามกลางการสวดมนต์ของชาวฮินดูและเรียกร้องให้คืนทรัพย์สินบางส่วนให้ปากีสถานตามแผนการแบ่งแยกประเทศที่ตกลงกันไว้นั้น
ส่งผลให้มีส่วนไม่พอใจของชาวฮินดูจึงวางแผนฆ่าคานธี และเขาถูกยิงถึงแก่กรรมวันที่ 30 มกราคม พ.ศ. 2491 หลังจากคานธีเลิกอดอาหารและสงครามกลางเมืองได้เริ่มสงบลง การตายของคานธีมีส่วนทำให้การฆ่ากันสองฝ่ายในอินเดียยุติ
แต่การอพยพของชาวเมืองทั้งสองฝ่ายยังดำเนินต่อไปจนถึงปี พ. ศ. 2508 การอพยพเข้ามาอินเดียเดิมประมาณ 9 ล้านคน การอพยพเข้าสู่ปากีสถานประมาณ 6 ล้านคน
