จากบันทึกเมื่อวานที่เว็บไซต์ ONLINE ANALYSIS TOOLS ของ Dr. Andrew Kropinski ในส่วนของ Alignments มีข้อมูลลิงค์เพียบดีจริงๆค่ะ นอกจากท่านจะเล่าย่อๆว่าใช้ทำอะไรแล้ว ท่านยังมีการให้ความเห็นไว้ด้วย
ส่วนแรกเป็นการเปรียบเทียบ 2 sequence ลิงค์ที่ท่านแนะนำไว้มี 8 ที่คือ
- ALIGN Query เป็นของ GENESTREAM SEARCH network server IGH Montpellier, France โดยใช้ sequence data อันนี้ ท่านอ.Dr. Kropinski ท่านบอกว่า output สวยดี (เอาไว้ลองแล้วจะมาเสริมสนับสนุนนะคะ หรือถ้าใครลองแล้วก็บอกกันบ้างนะคะ)
- LALIGN อันนี้ของ EMBnet เอาไว้หา segment ย่อยๆที่ตรงกันของ 2 sequence โดยให้ผลเป็น % identity ของแต่ละส่วน
- GraphAlin ของ Southwest Biotechnology&Informatics , U.S.A. ให้ผลทั้งกราฟฟิกและตัวเลข % identity ระหว่างโมเลกุลของโปรตีน, RNA หรือ DNA ก็ได้ด้วย
- NdPASA
- FFAS03
- LALIGN/PLALIGN -
- SIM
- Secondary Structure Element Alignment
