ประเทศไทยกับประเทศอินโดนีเซียมีความสัมพันธ์อันดีระหว่างกันเป็นระยะเวลานานแล้ว ในรัฐบาลของนาย สมัคร สุนทรเวช
นายกรัฐมนตรีและรัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหม จะเดินทาง
ไปเยือนประเทศอินโดนีเซียอย่างเป็นทางการ ระหว่างวันที่ 26-27 มีนาคม 2551 โดยมี นายนพดล ปัทมะ รมว.ต่างประเทศ
พล.อ.อนุพงษ์ เผ่าจินดา ผบ.ทบ.และคณะ จากการเดินทางไปครั้งนี้ ได้เจรจาขอซื้อก๊าซธรรมชาติ เพื่อแลกเปลี่ยนกับข้าวไทย การทำประมงและเจรจาขอชาวประมงที่ติดคุกในประเทศอินโดนีเซียกลับมารับโทษในประเทศไทย