อย่างที่กล่าวแล้ว โมเลกุล HLA มีความหลากหลายมาก คือแต่ละยีนมีหลายอัลลีล (พูดโดยใช้ศัพท์เฉพาะว่า มีจำนวนโพลีมอร์ฟสูงมาก---โพลีมอร์ฟ คือ หลายรูป นั่นเอง) บางยีนมีเกือบถึงพันอัลลีล และเมื่อเวลาผ่านไป ก็พบอัลลีลใหม่ขึ้นเรื่อยๆ อัลลีลใหม่ๆเหล่านี้ไม่ได้ เป็นผลจากกระบวนการแลกเปลี่ยนยีน (รีคอมบิเนชัน) แต่เป็นความแตกต่างของนิวคลีโอไทด์ ที่เกิดขึ้นตามธรรมชาติ
แนวความคิดของการจัดจำแนก โมเลกุล HLA เป็นกลุ่มๆ เกิดขึ้นครบ 10 ปีในปีนี้ โดยความคิดว่า ถ้าต้องการที่จะพัฒนา วัคซีนสำหรับมะเร็งหรือโรคติดเชื้อ โดยอาศัยอิพิโทพ เพื่อให้เป็นวัคซีนที่มีประสิทธิภาพ อิพิโทพที่จะเลือกใช้ จะต้องเป็นสายเปปไทด์ที่ โมเลกุล HLA จำนวนมากชอบจับ และดังนั้นจะต้องเป็นวัคซีน ที่สามารถนำไปใช้ หรือครอบคลุมประชากรจำนวนมากๆ
การรวบรวมข้อมูลของเปปไทด์ที่เป็นอิพิโทพ พบว่ามีความคล้ายกันของ กรดอะมิโนในบางตำแหน่ง และเมื่อวิเคราะห์ ในโมเลกุลของ HLA (หรือ MHC) ในตำแหน่งที่ใช้จับ (pocket = ผมใช้ภาษาไทยแทนว่า กระเปาะ) ก็พบว่า มีความเหมือนหรือคล้ายกัน ของกรดอะมิโนที่เกิดเป็นองค์ประกอบ ของกระเปาะนี้ โดยใช้ทั้งสองข้อมูลนี้รวมกัน โมเลกุลของ HLA อัลลีล (หรือ ชนิด =type) ต่างๆก็สามารถ รวมกันเข้าเป็นกลุ่มๆได้ เรียก Supertype (นึกไม่ออกจะใช้คำไทยว่ากระไร ตอนนี้ขออ้างโดยใช้ทับศัพท์ ว่า ซูเปอร์ทัยป์)
รายละเอียดมากขึ้น อยู่ที่ ไบโออินฟอร์เมติกส์ ไดเจ็สท์ ที่ http://www.u-sabai-d.com/blogWP/?p=12
อย่างไรก็ตามผมกำลังจะเพิ่ม ข้อมูลต่อท้ายอีก ดังนั้น ถ้าต้องการรายละเอียดมากขึ้น อาจต้องแวะมาอีกรอบ ขอบคุณที่แวะเข้ามาครับ ขอเชิญแลกเปลี่ยนรู้และติดดาว (อยู่ที่ท้ายหน้า) ให้บทความด้วยครับ
เกือบลืม สำหรับ เรื่องการใช้ชีวสารสนเทศ มาช่วยจัดจำแนกจะกล่าวในตอนต่อไป
ไบโออินฟอร์เมติกส์ กับ การจัดจำแนก HLA
