แต่อย่างไรก็ตาม พระพุทธศาสนาไม่ได้หยุดอยู่แค่การยอมรับความรู้ทางวิทยาศาสตร์ และความคิดเชิงเหตุผลเท่านั้น เพราะเหล่านี้เป็นเพียงโลกียปัญญา พระพุทธองค์ทรงสั่งสอนธรรมะขั้นสูงในระดับอุตรภาพ (Transcendental Truth) ซึ่งเป็นปัญญาในระดับโลกุตตระ ที่อยู่เหนือความรู้ทางวิทยาศาสตร์และความคิดเชิงเหตุผล ซึ่งการจะเข้าถึงส่วนนี้ได้ต้องอาศัยการเจริญจิตตภาวนา หรือ สมถะและวิปัสสนากรรมฐาน ซึ่งเป็นโลกุตรปัญญาอันเป็นปัญญาขั้นสูงสุดของพระพุทธศาสนา