น้ำหกเหลี่ยมมีโครงสร้างหรือกลุ่มโมเลกุลของน้ำขนาดเล็ก คลื่นพลังงานแม่เหล็กทำให้เกิดการปรับตัวของโครงสร้างโมเลกุลของน้ำใหม่ ซึ่งจะประกอบด้วยน้ำโมเลกุลขนาดเล็กจำนวน 6 โมเลกุล เกาะกลุ่มเรียงตัวกันอย่างมีระเบียบในรูปทรงกลมหรือหกเหลี่ยม ยิ่งกลุ่มโมเลกุลของน้ำมีขนาดเล็กเท่าไหร่ก็ยิ่งทำให้น้ำมีคุณภาพมากขึ้นเท่านั้น