การกำหนดมาตรฐานปุ๋ยขึ้นมาก็เพื่อที่จะควบคุมคุณภาพให้ได้ปุ๋ยที่ดี เป็นประโยชน์ต่อเกษตรกร อาจทำให้คนบางกลุ่มเสียประโยชน์ไปบ้าง โดยเฉพาะพวกเห็นแก่ตัวที่หวังจะกอบโกยผลประโยชน์จากการจำหน่ายปุ๋ยที่ตนผลิตออกมาแบบชุ๋ยๆอย่างที่ทราบกันอยู่โดยไม่ได้มีจิตรสำนึกในสิ่งที่ตัวเองกระทำ เพราะตลาดปุ๋ยอินทรีย์ในประเทศไทยมีการเติบโตขึ้นเรื่อยๆ ถ้าไม่มีการควบคุมการผลิตที่ดี ย่อมส่งผลให้เกิดการผลิตปุ๋ยที่ด้อยคุณภาพ หรือปุ๋ยอินทรีย์ปลอมออกมา สร้างความเดือดร้อนให้แก่เกษตรการที่ไม่มีความรู้ทางด้านปุ๋ยอินทรีย์ ดังเช่นในปัจจุบันที่นำปุ๋ยอินทรีย์มาผสมกับปุ๋ยเคมีในลักษณะของการปั้นเม็ดปุ๋ยแล้วฉีดพ่นด้วยแอมโมเนียมซัลเฟต ก่อนบรรจุกระสอบ ซึ่งจะมีกลิ่นเหม็น และจะเห็นผลในระยะสั้นๆ และผิด พรบ.ปุ๋ย ปุ๋ยอินทรีย์ที่ผสมกับเคมี ต้องขึ้นทะเบียนเป็นปุ๋ยเคมี-อินทรีย์ ผสมในอัตราส่วนที่กรมวิชาการเกษตรกำหนด (http://ionique.blogspot.com)