การวางแผนกลยุทธ์กับการวางแผนปฏิบัติการ เป็นการวางแผนเหมือกันแต่เริ่มต้นไม่เหมือนกัน การวางแผนกลยุทธ์เริ่มจากผลลัพธ์หรือจุดมุ่งหมาย(Ends)ไปหาวิธีการและปัจจัยนำเข้า(Means) แต่การวางแผนปฏิบัติการเริ่มจากปัจจัยนำเข้าและวิธีการไปสู่ผลลัพธ์ ดังนั้นการวางแผนกลยุทธ์จึงวางอยู่บนความไม่แน่นอน ไม่ชัดเจนนักเพราะต้องคาการณ์สถานการณ์ในอนาคตประกอบด้วย ในขณะที่การวางแผนปฏิบัติการต้องมีความชัดเจนว่าจะใช้อะไรบ้าง จะทำอย่างไรบ้างและตั้งเป้าตัวเลขไว้เท่าไร การวางแผนปฏิบัติการจึงเป็นลักษณะของการใช้กลวิธีหรือยุทธวิธี(Tactics)ให้งานสำเร็จ ขณะที่กลยุทธ์จะเป็นการทำงานให้สำเร็จได้อย่างไรภายใต้ความจำกัดต่างๆ