สำนักบริหารพื้นที่อนุรักษ์ที่ 3 ได้จัดตั้งขึ้นปีพ.ศ. 2445 รวมเวลาที่ได้ก่อตั้งถึงปัจจุบันประมาณ 101 ปีตั้งอยู่ริมแม่น้ำแม่กลองฝั่งซ้ายบนเนื้อที่แบ่งเป็น 2 แปลงเนื่องจากมีถนนค่ายหลวงตัดผ่านรวมเนื้อที่ทั้งหมด 9 ไร่ 2 งาน 51 ตารางวาการได้มาของที่ดินแปลงที่ 1 ซื้อจากนางเหมเป็นเงิน 400 บาทเมื่อพ.ศ.2445 แปลงที่ 2 ซื้อจากหลวงนารักษ์เป็นเงิน 180 บาท
<p style="margin: 0cm 0cm 0pt" class="MsoNormal">เดิมเรียกว่า “ที่ทำการป่าไม้มณฑลราชบุรี” ต่อมาได้พัฒนาไปตามการแบ่งส่วนราชการป่าไม้เป็นป่าไม้ภาคราชบุรีที่ทำการป่าไม้เขตบ้านโป่งและสำนักงานป่าไม้เขตบ้านโป่งตามลำดับต่อมาได้มีพระราชกฤษฎีกาโอนการบริหารและอำนาจหน้าที่ของส่วนราชการให้เป็นไปตามพระราชบัญญัติปรับปรุงกระทรวงทบวงกรมพ.ศ. 2545 ให้จัดตั้งกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมพร้อมทั้งแบ่งส่วนราชการเป็นกรมอุทยานแห่งชาติ สัตว์ป่า และพันธุ์พืช ขึ้นและได้มีกฎกระทรวงแบ่งส่วนราชการกรมอุทยานแห่งชาติ สัตว์ป่า และพันธุ์พืชแบ่งการบริหารงานเป็นสำนักบริหารจัดการในพื้นที่ป่าอนุรักษ์ 5 และเมื่อได้มีการปรับปรุงตามกฎกระทรวงแบ่งส่วนราชการเมื่อ พ.ศ.2547 ให้จัดตั้งสำนักบริหารพื้นที่อนุรักษ์</p>