การทำงานของสมองส่งผลต่อการทำงานทางด้านจิตใจของมนุษย์ ซึ่งแต่ละบริเวณของสมองก็จะทำหน้าที่แตกต่างกันในการควบคุมจิตใจ เช่น สมองส่วนหน้า จะส่งผลให้เกิดความคิดในการวางแผนตัดสินใจ , บริเวณสมองส่วนหนึ่งจะส่งผลให้เกิดอารมณ์กลัว เศร้า และโกรธ แต่ถ้าสมองบริเวณเหล่านี้ทำงานไม่สมดุลกันหรือทำงานผิดปกติก็จะส่งผลให้เกิดการทำงานของจิตใจที่บกพร่องไปด้วยและส่งผลมาถึงพฤติกรรมในทางที่ไม่ดีที่แสดงออกมาจากตัวเราเอง ดังนั้นในทางกิจกรรมบำบัดจึงเน้นไปที่การบำบัดรักษาให้มีสุขภาวะทางจิตที่ดี มีความสมดุลทางความคิดและอารมณ์เพื่อที่จะส่งผลให้เกิดพฤติกรรมที่ดีที่แสดงออกมา เช่น การใช้ CBT, MI และ การตั้งคำถามด้วย 5Why ในการปรับเปลี่ยนความคิดที่ส่งผลต่อพฤติกรรม , การใช้ Touch therapy สัมผัสเพื่อถ่ายทอดความรักให้แก่ผู้รับบริการ , การใช้ Sound therapy การใช้เสียงเป็นตัวกระตุ้น เพิ่มการได้ยิน ปรับความสมดุลในสมอง เช่น การฟังเพลง เป็นต้น