ปัญหาของการพัฒนาหลักสูตรคือปัญหาที่เกิดขึ้นในกระบวนการพัฒนาหลักสูตร ที่เป็นปัญหาอันเกิดจากการร่วมคิด ร่วมทำ ร่วมกันสร้างหลักสูตร และร่วมกันนำหลักสูตรไปใช้ มีดังนี้

1. หน่วยงานที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาหลักสูตรไม่เข้าใจบทบาทหน้าที่ของตน

2. ขาดการประสานงานหน้าที่ที่ดีระหว่างหน่วยงานต่างๆที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาหลักสูตร

3. ผู้บริหารระดับต่างๆเห็นว่าหลักสูตรเป็นหน้าที่ของหน่วยงานที่รับผิดชอบโดยเฉพาะ

4. ปัญหาการไม่เปลี่ยนแปลงการเรียนการสอนของครูตามแนวทางของหลักสูตร

5. ปัญหาการเผยแพร่หลักสูตร การสื่อสารทำความเข้าใจในหลักสูตรที่พัฒนาขึ้นใหม่

-หน่วยงานที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาหลักสูตรไม่เข้าใจบทบาทหน้าที่ของตน  

   หน่วยงานที่เกี่ยวข้องในทีนี้หมายถึงหน่วยงานที่มีความสำคัญในการกำหนดลักษณะของหลักสูตรที่ให้สถานศึกษาในการจัดการเรียนการสอน ให้ตรงกับกับบทบาทและการพํฒนาประเทศในยุคไทยแลนด์ 4.0 โดยเน้นเนื่อหาหลักให้สอดคล้องการกับพัฒนาของประเทศ เศรษฐกิจ และสังคม โดยหน่วยงานได้มีบทบาทในการกำหนดหลักสูตรให้สอดคล้องกับหลักการเหล่านี้ แต่หากมองในยุคปัจจุบันนักพัฒนาหลักสูตรหรือผู้ที่มีส่วนในการพัฒนาหลักสูตรนั้นยังไม่เข้าใจในบทบาทหน้าที่ของตนเองมากนัก โดยจะพัฒนาหลักสูตรให้สอดคล้องไปในแนวทางเดียวกันหรือมองในภาพรวมเป็นส่วนใหญ่ซึ่งจะทำให้การใช้หลักสูตรมีความไม่เท่าเทียมกันในแต่ล่ะโรงเรียนหรือสถานศึกษษที่ได้รับหลักสูตรไปใช้นการเรียนการสอน

-ขาดการประสานงานหน้าที่ที่ดีระหว่างหน่วยงานต่างๆที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาหลักสูตร

  การประสานงานเป็นสิ่งที่จำเป็นมากหากจะเริ่มทำการพัฒนาอะไรสักอย่างซึ่งเป็นไปได้ยากหากขาดการติดต่อประสานงาน การประชาสัมพันธ์ หรือการร่วมมือกัน เป็นต้น ในปัจจุบันการใช้หลักสูตรมีการใช้ในสถานศึกษาทั่วไปแต่ที่เห็นได้ทั่วไปครูเป็นผู้สอนโดยสอนตามหลักสูตรแต่เมื่อสอนนักเรียนหรือผู้เรียนไปเเล้วนั้นครูและสถานศึกษานั้นขาดการทบทวนเนื้อหาในหลักสูตร ว่าดีแล้วหรือไม่ มีการประเมินหลักสูตรหรือไม่ ขาดการประสานงานระหว่างสถานศึกษา ระหว่างหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง ซึ่งจะทำให้เป็นจุดบกพร่องในการพัฒนาการใช้หลักสูตรในปัจจุบัน ดังนั้นการจะพัฒนาให้ดียิ่งขึ้นซึ่งได้แก่การ เชื่อมโยงส่วนย่อยต่างๆ เข้ามาเป็นหนึ่งเดียวกัน ก็คือการติดต่อประสานงานจึงจะก่อให้เกิดความสำเร็จขึ้น

-ผู้บริหารระดับต่างๆเห็นว่าหลักสูตรเป็นหน้าที่ของหน่วยงานที่รับผิดชอบโดยเฉพาะ

  ผู้บริหารระดับสูงนั้นเห็นถึงการพัฒนาหลักสูตรคือการที่ให้หน่วยงานที่มีความรับผิดชอบโดยเฉพาะดูแลรับผิดชอบที่มีหน้าที่พัฒนาปรับปรุง เปลี่ยนแปลงโดยให้ผู้ที่มีส่วนเกี่ยวข้องโดยเน้นที่การออกหลักสูตรมาให้ทันใช้ให้ทันในยุคที่มีการเจริญเติบโตอย่างรวดเร็ว แต่ขาดการประเมินการวิเคราะห์หลักสูตรในแต่ล่ะสถานศึกษาอย่างชัดเจน เนื่องจากในแต่ล่ะสถานที่ย่อมมีความแตกต่างกันเช่น วิถีชีวิต ประเพณี วัฒนธรรม เป็นต้น ผู้บริหารหรือผู้ที่มีส่วนเกี่ยวข้องควรตระหนักถึงการใช้และการพัฒนาหลักสูตรเพื่อให้ได้หลักสูตรที่เหมาะสม ในแต่ล่ะสถานศึกษา

-ปัญหาการไม่เปลี่ยนแปลงการเรียนการสอนของครูตามแนวทางของหลักสูตร

ปัญหาซึ่งน่าจะนับว่าเป็นปัญหาใหญ่ของการพัฒนาหลักสูตรเลยก็ว่าได้เรื่องจากผู้ที่สามารถถ่ายทอดความรู้ให้สู้ผู้เรียนคือครูซึ่งครูมีหน้าที่ สอนให้ความรู้แก่ผู้เรียนและความรู้ที่ให้ย่อมเป็นความรู้ที่เป็นประโยชน์มากที่สุดในโลกยุคปัจจุบันแต่เนื่องจากโลกในยุคนี้หรือยุค 4.0 นั้นมีการเปลี่ยนแปลงมากมายเช่น เทคโนโลยีที่ก้าวไกล มาก ซึ่งหากครุในยุคก่อนหรือยุคปัจจุบันไม่ปรับตัวให้เท่าทันกับการเปลี่ยนแปลงการเรียนการสอนที่เป็นไปตามหลักสูตรที่ออกมาให้เท่าทันยุคสมัยนั้นทำได้ยาก ซึ่งจะเหมือนเป็นการสอนที่อิงแบบเดิมๆคือครูบรรยาย หรือครูเล่าเรื่องซึ่งไม่สอดคล้องการการเรียนการสอนในยุคใหม่ ดังนั้นนักเรียนจึงได้รับความรู้ที่ไม่เท่าเทียมหรือทันสมัย อีกประการคือครูไม่ยอมรับในหลักสูตรที่มีการพัฒนาหรือจะสอนยึดติดกับแบบเดิมๆ โดยไม่มีการปรับเปลี่ยนหลักสูตรเลยแม้แต่น้อย ซึ่งปัยหาในข้อนี้เป็นปัญหาที่แก้ไขยากแต่หากจะแก้ไขได้คือการร่วมมือกันของผู้สอน โดยให้มีการ ประเมินหลักสูตร การกำหนดหลักสูตรให้เหมาะสมและสอดคล้อง และการปรับปรุงพัฒนาที่ตัวของผู้สอนเองด้วย

-ปัญหาการเผยแพร่หลักสูตร การสื่อสารทำความเข้าใจในหลักสูตรที่พัฒนาขึ้นใหม่ 

  การเผยแพร่เป็นสิ่งที่จำเป็นสำหรับสิ่งใหม่ๆที่ได้ถูกพัฒนาขึ้นดังนั้นเมื่อมีการพัฒนาปรับปรุงหลักสูตรขึ้นมาการเผยแพร่ประชาสัมพันธ์ มากทั้งนั้เพื่อให้ผู้สอนได้รับทราบถึงหลักการ หรือวิธีการสอนที่สอดคล้องกับสถานการณ์ในยุคปัจจุบัน และยังช่วยให้แนวทางในการศึกษาของประเทศไทยมีแนวโน้มที่จะพัฒนาไปในแนวทางเดียวกันอีกด้วย แต่ปัจจุบันการเผยแพร่หลักสูตรหรือการพัฒนาหลักสูตรนั้นการเผยแพร่ทำได้ค่อนข้างยากเนื่องจากปัจจุยหลายๆด้านเช่น การให้ความสนใจของผู้คนในยุคปัจจุบัน การขาดการส่งเสริมสนับสนุน จากภาครัฐและเอกชน เป็นต้น ดังนั้นหากขากการเผยแพร่จะส่งผลทำให้การใช้หลักสูตรที่ได้รับการพัฒนามาแล้วนั้นเป็นไปได้ด้วยความยากลำบาก

สรุป แนวโน้มการพัฒนาหลักสูตรให้มีความสอดคล้องกับยุคปัจจุบัน

 จากปัญหาข้างต้นนั้นส่วนใหญ่เป็นปัญหาที่เกิดขึ้นมานานแล้วหากจะมีการเปลี่ยนนั้นอาจจะทำได้ยากแต่ถ้าเราร่วมมือกันในทั้งภาครัฐ เอกชนหรือบุคคลที่เกี่ยวข้องแล้วการทำงานหรือการที่จะพัฒนานั้นจะเป็นไปด้วยความเรียบร้อยเนื่องจากการร่วมมือร่วมใจกัน ในการพัฒนาสิ่งที่เป็นสิ่งที่สำคัญที่สุดของประเทศหรืออนาคตคือ ผู้ที่ได้รับความรู้และผู้นั้นก็คือ ลูกหลานของเราและก็คืออนาคตของประเทศชาตินั้นเองหากไม่มองเห็นความสำคัญของการศึกษาประเทศไทยของเราคงก้าวต่อไปไม่ได้เพราะติดอยู่กับการศึกษาที่ล้าสมัยไม่ทันต่อการพัฒนาในยุคปัจจุบันที่ไปได้อย่างรวดเร็วมาก หากแต่จะสำเร็จจะต้องร่วมแรงร่วมใจของหน่วยงาน หลายๆหน่วยงานและประชาชนชาวไทยอีกด้วย