สาเหตุของปัญหาทางการเรียนรู้้้้้้้้้้ 
1. องค์ประกอบทางร่างกายและทางชีวภาพ สาเหตุนี้เกิดจากสภาพความบกพร่องของเด็ก โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ความบกพร่องทางสมองที่ทำหน้าที่ไม่สมบูรณ์ การบาดเจ็บอันเกิดที่สมอง หรือกระบวนการทางจิตวิทยาของมนุษย์ ได้แก่ การับรู้ของร่างกายต่อสิ่งต่าง ๆ รอบตัวผิดปกติ ส่วนใหญ่ที่สุดแล้วสภาพทางชีววิทยาของเด็กที่เชื่อว่ามีผลต่อการเรียนรู้มาก เด็กที่มีความบกพร่องทางสมองและทางรับรู้ ( เกิดจากประสาทส่วนกลางทำหน้าที่ไม่สมบูรณ์ ) มีผลทำให้การรับรู้ผิดไป
2. องค์ประกอบทางพันธุกรรม ปัจุบันมีข้อมูลการวิจัยชี้แนวโน้มว่าความด้อยความสามารถทางการเรียนรู้เกิดเหมือนกันในครอบครัวเดียวกัน แม้ว่าจะเกี่ยวข้องกับพันธุกรรม หรือไม่ก็ตามก็เป็นประเด็นที่ควรทำการวิจัยต่อไป ผลการวิจับเกี่ยวข้องกับเด็กแฝดพบว่า เมื่อเด็กคนหนึ่งเป็นเด็กด้อยความสามารถในการอ่าน เด็กแฝดอีคนหนึ่งก็มีแนวโน้มเป็นเช่นเดียวกัน ถ้าทั้งคู่เป็นเด็กแฝดแท้
3. องค์ประกอบทางสิ่งแวดล้อม มีหลักฐานชี้ชัดว่า เด็กที่อยู่ในสภาพแวดล้อมที่เสียเปรียบมีแวโน้มมีปัญหาทางการเรียนรู้มากกว่า แต่ก็ยังมีข้อสงสัยกันว่า เกิดมาจากประสบการณ์การเรียนรู้ที่ไม่เหมาะสมหรือเกิดจากจากองค์ประกอบทางชีววิทยากันแน่ เช่นสภาพที่สมองถูกทำลายหรือภาวะทุพโภชนาการ
