เมื่อฟันผุลึกมากขึ้นจนถึงโพรงประสาทฟัน เด็กจะเริ่มมีอาการปวด ในระยะนี้จะทำการอุด หรือครอบฟันเลยไม่ได้ จะต้องทำการรักษารากฟันหรือรักษาโพรงประสาทฟันก่อน อย่าเข้าใจผิดคิดว่าฟันน้ำนมผุแล้วไม่มีผลอะไร เดี๋ยวฟันแท้ก็ขึ้นมาแทนที่ เพราะหากผุมาก ๆ เกิดการอักเสบบวมมาก ๆ อาจถึงขั้นเสียชีวิตได้ หรือถ้าหากเด้กต้องเสียฟันน้ำนมไปก่อนวัยอันควรจะทำให้การขึ้นของฟันแท้ไม่สมดุล

                เมื่อฟันผุลึกมากขึ้นจนถึงโพรงประสาทฟัน เด็กจะเริ่มมีอาการปวด ในระยะนี้จะทำการอุด หรือครอบฟันเลยไม่ได้ จะต้องทำการรักษารากฟันหรือรักษาโพรงประสาทฟันก่อน

                ในฟันที่อาการปวดเกิดจากสิ่งกระตุ้น เช่นความร้อน ความเย็น การอุดติดของเศษอาหาร เมื่อกำจัดสิ่งกระตุ้นแล้วก็จะหายปวด อาการเช่นนี้หากทันตแพทย์กรอเนื้อฟันผุแล้วพบว่ารอยผุเกือบทะลุโพรงประสาทฟัน หรือมีรอยทะลุเป็นจุดเล็ก ๆ  ก็จะทำการรักษาโดยการรักษาโพรงประสาทฟัน (Pulpotomy) ซึ่งการรักษาโพรงประสาทฟันจะทำโดยการกรอกำจัดเนื้อโพรงประสาทฟันเฉพาะในส่วนตัวฟัน ไม่ถึงรากฟัน ใส่ยา และอุดฟันด้วยวัสดุอุด จากนั้นจึงทำการครอบฟัน

                หากฟันผุ ที่เด็กมีอาการปวด แบบอยู่เฉย ๆ ก็ปวด ตื่นขึ้นมาร้องไห้ปวดตอนกลางคืน อาการเช่นนี้บ่งบอกถึงการผุที่ทะลุโพรงประสาทฟันไปแล้ว  หรือในกรณีที่ฟันผุมาก ๆ  แต่เด็กไม่มีอาการปวด โดยให้ประวัติว่าเคยปวด แต่หายไปแล้ว  (ซึ่งกรณีนี้เกิดจากฟันผุจนเส้นประสาทฟันถูกทำลายไปจนหมด จึงไม่มีเส้นประสาทฟันรับความรู้สึกปวดหลงเหลืออยู่)  ซึ่งทั้ง 2 กรณีนี้จะทำการรักษาโดยการรักษารากฟัน (Pulpectomy) โดยจะทำการกำจัดเนื้อโพรงประสาทฟันทั้งในส่วนของตัวฟันและรากฟันจนหมด ทำการใส่วัสดุเข้าไปแทนที่  จากนั้นจึงทำการครอบฟัน

                ในกรณีฟันผุมาก ๆ จนกระทั่งโพรงประสาทฟันถูกทำลายไปหมดจนไม่มีอาการปวดและไม่ทำการรักษา โพรงประสาทฟันที่ถูกทำลายจะตาย (necrosis) จากนั้นโพรงประสาทฟันจะเริ่มเป็นพิษ มีอาการอักเสบที่บริเวณปลายรากฟัน จนสังเกตได้จากการมีตุ่มหนองบริเวณเหงือกในฟันซี่นั้น ๆ    ในกรณีนี้การรักษาขึ้นอยู่กับดุลพินิจของทันตแพทย์ ส่วนใหญ่ทันแพทย์จะทำการถอนและใส่เครื่องมือกันช่องว่าง (space maintainer)  หากจำเป็นต้องรักษาจริง ๆ เช่นฟันแท้ซี่แรกยังไม่ขึ้น (ทำให้ใส่เครื่องกันช่องว่างไม่ได้) หรือผู้ปกครองไม่ต้องการให้ถอน ทันตแพทย์ก็จะทำการรักษารากฟันให้ (ซึ่งก็ต้องยอมรับถึงความเสี่ยงที่การรักษาอาจจะล้มเหลว และต้องถอนฟันก่อนกำหนดได้) 

                ในกรณีการผุที่มีการอักเสบมาก ๆ เด็กอาจเกิดอาการบวมออกมาบริเวณใบหน้า ในกรณีนี้ทันตแพทย์จะให้ยาแก้อักเสบให้การบวมทุเลาลงก่อนจึงทำการรักษาให้ แต่ในบางครั้งที่การบวมมีความรุนแรงมาก ๆ  เช่นบวมถึงบริเวณรอบดวงตา หรือบวมลงมาถึงใต้คาง ในกรณีนี้ทันตแพทย์จำเป็นต้องทำการ Admit ให้เด็กนอนรักษาที่โรงพยาบาล เพื่อให้น้ำเกลือและยาทางเส้นเลือด เพื่อให้การบวมทุเลาลงก่อน

           จะเห็นได้ว่าการรักษาฟันผุในฟันน้ำนมนั้น การป้องกันเป็นสิ่งที่ดีที่สุด เพราะการรักษาจะยากและเสียค่าใช้จ่ายมากยิ่งขึ้นตามระดับความรุนแรงของโรค  การป้องกันไม่ให้เกิดการผุ เมื่อผุแล้วรีบทำการรักษา เป็นสิ่งที่ผู้ปกครองพึงกระทำ

           อย่าเข้าใจผิดคิดว่าฟันน้ำนมผุแล้วไม่มีผลอะไร เดี๋ยวฟันแท้ก็ขึ้นมาแทนที่ เพราะหากผุมาก ๆ เกิดการอักเสบบวมมาก ๆ อาจถึงขั้นเสียชีวิตได้ หรือถ้าหากเด้กต้องเสียฟันน้ำนมไปก่อนวัยอันควรจะทำให้การขึ้นของฟันแท้ไม่สมดุล เกิดการซ้อนเก ต้องจัดฟัน หรือหากไม่จัดฟันฟันก็จะเรียงตัวไม่ดี ทานอาหารติด เกิดการผุได้ง่ายยิ่งขึ้นในฟันแท้  และปัญหาก็จะตามมาอีกจนต้องสูญเสียฟันแท้ไปในที่สุด